Arnaud Ungaro

Administrateur Infrastructure Informatique | Bio-informatique & Génomique | Docteur en Écologie

Professionnel de l'infrastructure informatique et scientifique, je conçois mon métier comme un travail d'architecture pragmatique et exigeante, orienté vers la stabilité, la maîtrise technique et la durabilité des systèmes.

Docteur en écologie et bio-informatique, je développe et administre des infrastructures complexes tout en conduisant des projets d'analyse génomique et transcriptomique, en m'appuyant sur une double compétence scientifique et informatique solidement ancrée.

Fort de plus de 15 ans d'expérience, je privilégie une approche rationnelle, en construisant des solutions robustes, fiables et optimisées pour durer, loin des effets de mode technologiques.
Ma pratique repose sur une compréhension fine des environnements UNIX/Linux, du stockage, des réseaux, et sur la rigueur analytique héritée de la recherche scientifique.

Je me distingue par ma capacité à traverser les disciplines sans cloisonnement, à concevoir des architectures techniques solides et à conduire des projets bio-informatiques exigeants avec la même exigence d'efficacité, de stabilité et de précision.

• Infrastructures : Administration de serveurs et gestion d'environnements virtualisés, optimisation des systèmes pour une haute performance, gestion d'hébergement mutualisé et dédié.
• Stockage et Virtualisation : Bonne maîtrise des technologies de stockage (Ceph, HP Nimble, TrueNAS, Synology NAS) et des solutions de virtualisation évolutives.
• Réseaux et Sécurité : Gestion des firewalls Cisco ASA, Fortigate, Arbor, implémentation de solutions Zero Trust avec Teleport, et gestion avancée de DNSSEC.
• SSO et gestion des identités : Administration des solutions SSO avec OpenAM.
• Postes de travail : Gestion des postes de travail sous Linux et utilisation quotidienne de MacOS comme environnement de travail.
• Gestion du parc et des tickets : Expertise dans la gestion du parc et du stock avec GLPI, et gestion des tickets avec RT (Request Tracker) et Zendesk.
• Bio-informatique : Développement de solutions logicielles pour l'analyse génomique et transcriptomique, et gestion des systèmes pour des projets de recherche.
• Autodidacte : Apprentissage continu et adaptation rapide à de nouveaux défis techniques et technologiques.

Je me distingue par ma capacité à fournir des solutions techniques performantes et à maintenir un haut niveau de satisfaction client dans des environnements complexes et exigeants.

Expérience Professionnelle

Depuis mars 2025 : Administrateur Systèmes – Conservatoire Botanique National Alpin

• Administration de serveurs Linux hébergeant des applications internes (GeoNature, PostgreSQL..)
• Maintenance des bases de données et gestion de la sécurité des systèmes
• Supervision et maintien en condition opérationnelle d'une infrastructure scientifique et patrimoniale

Depuis 2019 : Entrepreneur Individuel – Administrateur Infrastructure Informatique | Bio-informatique & Génomique

• Développement de solutions bio-informatiques pour l’analyse et le traitement de données génomiques (RNA-seq, transcriptomique)
• Conception et administration d’infrastructures Linux pour des projets de recherche scientifique et des analyses de données de grande envergure
• Virtualisation (VMware, ProxmProfessionnel de l'infrastructure informatique et scientifique, je conçois mon métier comme un travail d'architecture pragmatique et exigeante, orienté vers la stabilité, la maîtrise technique et la durabilité des systèmes.

Docteur en écologie et bio-informatique, je développe et administre des infrastructures complexes tout en conduisant des projets d'analyse génomique et transcriptomique, en m'appuyant sur une double compétence scientifique et informatique solidement ancrée.

Fort de plus de 15 ans d'expérience, je privilégie une approche rationnelle, en construisant des solutions robustes, fiables et optimisées pour durer, loin des effets de mode technologiques.
Ma pratique repose sur une compréhension fine des environnements UNIX/Linux, du stockage, des réseaux, et sur la rigueur analytique héritée de la recherche scientifique.

Je me distingue par ma capacité à traverser les disciplines sans cloisonnement, à concevoir des architectures techniques solides et à conduire des projets bio-informatiques exigeants avec la même exigence d'efficacité, de stabilité et de précision.ox), gestion de stockage (Synology, TrueNAS, OpenMediaVault) et déploiement d'environnements de calcul intensif (HPC)

• Automatisation des workflows bio-informatiques (Python, Bash)
• Gestion de la sécurité et des performances des systèmes (audit, surveillance, optimisation)
• Gestion de services d’hébergement et d’infogérance pour des particuliers, professionnels et projets de recherche (VPS, Plesk, sauvegardes, sécurité)

2020 - 2024 : Administrateur Systèmes et Réseaux, SafeBrands / CentralNic Group PLC

• Administration et maintenance des serveurs UNIX/Linux
• Gestion des environnements de virtualisation VMware Vcenter et Proxmox PVE
• Implémentation et gestion des solutions de stockage (HP Nimble, Ceph, TrueNAS)
• Gestion de l'infogérance des clients Linux
• Gestion N2 de l'hébergement dédié et mutualisé (Plesk)
• Administration des noms de domaine avec Bind, Designate et gestion avancée de DNSSEC
• Gestion de la sécurité avec Cisco ASA, Fortigate, Arbor et implémentation Zero Trust avec Teleport
• Gestion des systèmes SSO avec OpenAM
• Gestion du parc et du stock avec GLPI
• Administration des plateformes de gestion des tickets via RT (Request Tracker) et Zendesk
• Utilisation quotidienne de MacOS comme environnement de travail et gestion des postes de travail Linux
• Auditeur Qualité Interne - ISO 9001

2014 - 2018 : Doctorant en Écologie Génomique, Électricité de France – IMBE UMR CNRS 7263-IRD 237

• Recherche sur les variations de l'expression génique induites par des perturbations environnementales
• Développement d'une suite logicielle pour inférer des transcriptomes et identifier des spécimens hybrides
• Séquençage Illumina et analyse des variations d'expression en réponse à des xénobiotiques

2014 : Ingénieur d'études, IMBE UMR CNRS 7263-IRD 237

• Spécialisation en techniques de biologie moléculaire et écologie

Formation Académique

• 2018 : Doctorat en Écologie, Aix Marseille Université
• 2013 : Master en Bio-informatique, Biochimie-Structurale et Génomique, Aix Marseille Université
• 2012 : Maîtrise en Bio-informatique, Biochimie-Structurale et Génomique, Université de la Méditerranée
• 2011 : Licence en Sciences de la Terre et de l'Environnement, spécialisation en Biologie, Évolution, et Environnement, Université de Provence

Expériences de Stage

• 2013 : Mise en place d'un pipeline d'analyse de données, IMBE UMR CNRS 7263-IRD 237
• 2012 : Extraction et amplification d'ADN génomique humain, Centre régional de lutte contre le cancer PACA, Institut Paoli-Calmettes
• 2012 : Analyse transcriptomique différentielle, TAGC UMR U1090 – INSERM
• 2012 : Développement logiciel pour l'étude génomique, IMBE UMR CNRS 7263-IRD 237
• 2010 : Développement logiciel pour l'étude du Trans-splicing, UMR-CNRS 6116 IMEP

Compétences Clés

• Administration/Maintenance : UNIX/Linux, PleskPanel
• Virtualisation : VMware, Proxmox PVE, OpenStack, ESXi
• Stockage : Ceph, TrueNAS, HP Nimble, Synology NAS
• Réseaux et sécurité : Cisco ASA, Fortigate, Arbor, DNSSEC, Teleport (Zero Trust)
• SSO et gestion des identités : OpenAM
• Postes de travail : Gestion de postes de travail sous Linux, utilisation quotidienne de MacOS
• Gestion du parc et des tickets : GLPI (gestion du parc et du stock), RT (Request Tracker), Zendesk
• Programmation : Python, Bash, SQL
• Matériel : Conception, montage et optimisation de serveurs et d'ordinateurs
• Biologie : Génétique, génomique, transcriptomique, biologie moléculaire, séquençage Illumina
• Expérience approfondie : Utilisation de Linux depuis 1998
• Notions : Électricité et électronique

Certifications et Formations Complémentaires

• 2021 : Auditeur Qualité Interne - ISO 9001
• 2017 : Formation pour les personnes impliquées dans la conception de procédures expérimentales sur les modèles aquatiques
• 2016 : Introduction à la gestion de projet, Habilitation électrique (H0B0)
• 2016 : Rédaction et publication d'articles scientifiques en Sciences de la Vie, Utilisation de Zotero
• 2015 : Propriété intellectuelle et gestion de l'information stratégique, Droits des chercheurs

Langues

• Français : Natif
• Anglais : Niveau professionnel (TOEIC 860/990)

Publications et Projets

• Voskhod : Développement d'un pipeline d'analyse de transcriptomes hybrides.
• Publication : Challenges and solutions for transcriptome assembly in non-model organisms.

Expérimentations et Projets Personnels

• Mise en place d'un lab personnel pour expérimenter avec des technologies de hardware, virtualisation (ESXi, Proxmox PVE) et stockage (TrueNAS)
• Expérimentations avec des nano-ordinateurs comme le Raspberry Pi et des projets électroniques avec Arduino
• Projets divers en électronique

Informations Personnelles

• Permis de conduire : Catégorie B, formation 125 cm³

Centres d'intérêt

• Camping
• Plongée
• Bricolage
• Jardinage
• Informatique
• Photographie